一、增值税

对于软件定制开发项目而言，增值税通常是企业需要重点关注的税种之一。根据国家税务总局的规定，一般纳税人提供的信息技术服务适用13%的税率；而小规模纳税人的税率则为6%。

这里需要注意的是，具体适用哪个税率取决于企业的实际情况和税务认定结果。

二、企业所得税

除了增值税之外，企业还需要关注企业所得税。根据《中华人民共和国企业所得税法》，符合条件的软件开发企业在享受税收优惠政策的同时，还需缴纳25%的企业所得税。不过，对于高新技术企业和小型微利企业来说，可以按照15%或更低的税率来计算。

三、营业税

自2016年起，我国取消了营业税，并将其并入增值税中征收。因此，在当前税收体系下，已不再存在独立的营业税率问题。

通过上述对比我们可以看出，选择合适的税率对企业来说至关重要。一般来说，企业需要根据自身情况与专业税务顾问进行充分沟通后做出决定。

总结

无论是6%还是13%，企业都需关注各类税种及其对经营成本的影响，并据此制定合理的财务策略和业务规划。